馬桶可分為連體式馬桶和分體式馬桶。 分體式馬桶比較傳統，是用螺絲和密封圈將底座和水箱連接，占用空間大，連接處容易藏污納垢;連體式馬桶比較高檔，造型美觀，類型多樣，一體成型。 但價格相對昂貴。
根據排水方式，馬桶可以分為后排式和下排式兩種類型。后排式有時又被成為墻排馬桶和橫排，后排式馬桶的排污口中心距地一般是18cm;下排式是我們比較常見的排水方式，它的排水口在地面上。下排式馬桶排污口離墻距離主要分為400mm，305mm，200mm三種。
馬桶的選擇取決于污水排放的方向。如果是后排，一般選擇沖落式馬桶，沖落式馬桶排污口大而深，利用水的沖擊力直接排放污水，其缺點是沖洗聲大。如果是地排水的話，則一般使用虹吸式馬桶。虹吸式可以分為噴射型和漩渦型，虹吸的工作原理是借沖水在排污管內形成虹吸作用，將污水排出。虹吸式馬桶的優點是沖水聲音小，缺點是用水量較大。
